Azawakhs de Garde-Épée

 

Analyses Génétiques

ou la génétique Azawakhienne pour les débutants !

Cette page va vous expliquer les origines et la génétique de l'Azawakh et comment vous servir du site Azawakh Database et de ses fonctions d'analyse.

Dans l’analyse d’un pedigree on ne peut prendre en compte qu’un seul calcul. Il faut tenir compte de la consanguinité ainsi que de l’analyse de la proportion des chiens de fondation.

Le taux de consanguinité (inbreeding) est un élément indicateur, mais encore n’a t’il de signification que si l’on sait sur combien de générations il a été calculé. On peut très bien avoir 0% de consanguinité sur 3 générations, alors que les ancêtres peuvent tous être différents mais tous cousins ou frères et soeurs issus des mêmes chiens d’origines. Cette valeur de 0% ne reflétera donc absolument pas la réalité génétique du chien. Quand nous comparons des pedigrees, nous devons toujours considérer sur combien de générations le coefficient de consanguinité est calculé. Dans la Database, par défaut le taux correspond au nombre de générations affichées, il suffit de cliquer sur "consanguinité" (ou inbreeding en anglais) pour voir s'afficher la consanguinité sur la totalité des générations du chien.

Le coefficient de consanguinité est la mesure de la proportion de loci homozygotes dus au lien de parenté entre les parents d’un chien. En d’autres termes, c’est le pourcentage de la probabilité qu’un locus particulier soit homozygote par la relation entre les parents. Donc "100%" signifierait que le chien est homozygote pour chaque locus. Ce qui veut dire que pour chaque gène hérité de sa mère, un gène identique est aussi hérité de son père. Cela se produit quand le père et la mère sont étroitement apparentés ou jumeaux. Un coefficient de consanguinité de 0% signifie qu’aucun locus n’est homozygote car il n’existe aucun lien de parenté entre le père et la mère.

Quelques valeurs du coefficient de consanguinité :
Quand un chien est croisé avec son frère/sa soeur : 25 %
Quand un chien est croisé avec son père/sa mère : 25 %
Quand un chien est croisé avec son demi-frère/sa demi-soeur : 12.5 %
Quand un chien est croisé avec son grand-père/sa grand-mère : 12.5 %
Quand un chien est croisé avec un cousin/une cousine : 6,25 %

Le coefficient devrait croître de moins de 0.25 à 0.5 point par génération. Si cette augmentation est supérieure, une menace de problèmes de santé due à la consanguinité pèse sur la population considérée. Cela peut prendre plusieurs générations avant que ces problèmes soient évidents, mais quand ils apparaissent, ils sont très difficiles à éliminer de la lignée.

L’analyse de "Fondation" (foundation) correspond au pourcentage d’apport génétique de chacun des chiens de fondation (d’origine) dans la génétique du chien analysé. On considère comme chien de fondation un chien dont l’origine est inconnue, soit un chien importé d’Afrique (ou vivant en Afrique lorsque plusieurs de ses descendants ont été utilisés dans l’élevage).

Dans le tableau, ci-dessous, sont répertoriés les chiens de fondation à l'origine de la race Azawakh :

Lignée dite "française"
Années 1970

Lignée dite "Yougoslave"
années 1970

Russie
années 1980

Toboro II (M. Parigi) (Mali)
Takadamat (M. Chaventré) (Mali)
Adignaz (M. Parigi) (Mali)
Aikar (M. Parigi) (Mali)
Ahoura (Dr. Gaussens/Roussel) (Mali)
Targui (M. Foinant) (Burkina Faso)

Ileli (M. Chaventré) (Mali)
Taikart (M. Chaventré) (Mali)
Eheouel (M. Coppé) (Mali)
Reylane (M. Coppé) (Mali)

Il semble qu'il n'y ai aucun de ces descendants
dans les lignées actuelles d'azawakh
(mais en Sloughis français)

Gao (Mali)
Lara (Mali)
Darkoye Sidi (Burkina Faso)

Attar (Mali)
Ermad (Mali)

Autres Azawakhs importés d'Afrique (Mali, Burkina Faso et Niger)

1980 à 1990

après 1990

France

Allemagne

France

Allemagne

Autres pays

B'Kleine Drei
B'Tekewelt
Ejeker
C'Babasch
U'Malilee
Ulm
C'Oska
Djair
Bold Billy
Bold Birdy
El'Mir
E'Chipie-Ménaka

Mali
Yaris
Dazol In Chenan
Akschi
Salome
Aikar Azoul Elkor

Néférou
P'Ibis
T'Ramsès
Taïra
Taussit n'kel Dinnik
Bossi
Anza Layla

Abarut Ag Tin Akouf
Tainoss
Azol ag Tin Akouf
Dergil
Akaba
Azabor
Taohak
Amanar
Azol ag Manzerou
Inarar
Aybus

Safi
Talatei
Mariam (2)
Chaydara
Sheidara
Taytok
Kela
Sikara
Biyanou
Taikarte
Youf ag Kim

Taikoussou (Burkina)
Azabor (3) (Burkina)
Gris-Gris (Rep.Tchèque)
Ajor (Autriche)
Azabor (2) (Autriche)
Anubi ag Tin-Akof (Suisse)
Atri ak Mansoufouga (Suisse)
Djambe (Suisse)
Aurak-Injakok (Suisse)
Cadeau (Suisse)
Speedy (Italie)
Tigidit (Italie)
Agarouf (Italie)
Mariam (usa)
Tinberi (usa)
Hatshepsut (usa)
Inkadewane (usa)

- Plus le % d’un même chien de fondation est élevé dans un pedigree possédant de nombreuses générations, plus il y a homozygotie sur les gènes qu’il a transmis (bons et mauvais).
- Moins il y a de chiens de fondation sur de nombreuses générations, moins il y a de diversité génétique et de vigueur génétique dans le patrimoine du chien.

Exemples de consanguinité importante

Pedigree 1 - 1995
Consanguinité totale: 35 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

Toboro II
Takadamat
Adignaz

Gao
Darkoye Sidi
Lara
Aikar
Ahoura
Targui

23.4%
20.3%
16%
10.9%
10.9%
7.81%
6.64%
3.12%
0.781%

Pedigree 3 - 2003
Consanguinité totale: 18.3 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

Toboro II
Gao
Adignaz
Takadamat
Lara
Darkoye Sidi
Ahoura
Aikar
Targui

24.3%
15.5%

13.5%
12.5%
8.89%
8.4%
6.05%
5.76%
5.08%
 

Pedigree 2 - 1996
Consanguinité totale: 21.8 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

Toboro II
Gao
Takadamat
Adignaz
Lara
Darkoye Sidi
Aikar
Ahoura
Targui

22.7%
16.4%
14.1%
12.9%
10.2%
9.38%
5.86%
4.69%
3.91%


- Dans le pedigree 1 la consanguinité est telle qu'elle dépasse largement un mariage frère/soeur ou père/fille. Les 3 chiens de fondation de tête représentent 60% de la génétique du chien. Les risques de tares génétiques et de problèmes de santé ou de caractère sont importants.
- Le pedigree 2 correspond pratiquement à une consanguinité frère/soeur.
- Le pedigree 3 est relativement similaire au 2 avec un % de Toboro II plus important.
Remarque: Ces pedigrees sont le résultat de 20 ans, ou plus, de consanguinité sur les mêmes chiens.

Portées présentant des défauts génétiques

Pedigree 4 - France
Consanguinité totale : 20.4 %
Chiens de fondation

Apport
génétique

Toboro II
Takadamat
Adignaz

Targui
Bold Billy
Gao
Ahoura
Darkoye Sidi
Aikar
C'Babasch
Lara
B'Tekewelt
Ejeker

27.3%
15.2%
14%
9.38%
6.25%
5.96%
4.69%
4.1%
4%
3.12%
2.83%
1.56%
1.56%

 

Pedigree 5 - France
Consanguinité totale : 16.5%

Chiens de fondation

Apport
génétique

Toboro II
Takadamat
Adignaz
Gao
Targui
C'Babasch
B'Tekewelt
Ejeker
Darkoye Sidi
Ahoura
Lara
Aikar

23%
14.1%
12.1%
9.77%
7.81%
6.25%
6.25%
6.25%
3.91%
3.91%
3.52%
3.12%

Dans ces cas de figure on remarque que le pourcentage génétique concernant Toboro II est très élevé. Dans le pedigree 4, elle figure 7 fois dans les origines du père et 17 fois dans celles de la mère et ce sur 9 générations ! De plus, les 3 chiens de fondation les plus représentés cumulent 50% ou plus de la génétique des chiens. Sur 9 générations, tous les chiens descendent de seulement 12 ou 13 chiens d’origines différentes! On ne peut déduire de ces analyses que Toboro II soit plus fautive des problèmes génétiques que les autres ancêtres mais le fait d’avoir utilisé à maintes reprises dans les pedigrees des 2 parents les mêmes chiens ne peut qu’augmenter le risque de faire apparaître les tares récessives qu’ils portaient qui étaient jusque là contenues.

Exemples chez des chiens issus de mariages avec un nouvel import et un demi-import

Pedigree 6 - France 2003
Consanguinité totale: 0 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

Biyanou (import récent)
Toboro II
Takadamat

Adignaz
Bold Billy
Targui
C'Babasch
Darkoye Sidi
Aikar
Ahoura
B'Tekewelt
Ejeker
Lara
Gao

50%
12.3%

7.03%
6.45%
6.25%
3.91%
3.12%
1.95%
1.95%
1.95%
1.56%
1.56%
0.977%
0.977%
 

Pedigree 7 - France 1995
Consanguinité totale: 0 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

E'Chipie Menaka (import récent)
Toboro II
Takadamat
Adignaz
Targui
Ahoura
Aikar
Darkoye Sidi
Lara
Gao

50%
17.2%
9.38%
8.59%
6.25%
3.12%
2.34%
1.56%
0.781%
0.781%

Il faut toutefois toujours juxtaposer ces résultats au taux de consanguinité et au nombre de générations connues. Car un chien de fondation représentant 50% (pedigrees 6 et 7), lorsque le taux de consanguinité est de 0%, signifie que nous avons à faire à un mariage avec un nouvel import. Lui et ses ancêtres inconnus représentent 50% de la génétique, tout le reste a été transmis par l'autre parent. Il n’y a pas de consanguinité mais une augmentation de diversité génétique associée à une plus grande vigueur génétique.

Ce pedigree, au taux de consanguinité faible, est issu de 2 demis-imports. Les imports représentent 50% de sang neuf, faisant baisser considérablement les % des chiens d'origine des deux lignées française et yougoslave.

 

Pedigree 8 - France 2002
Consanguinité totale: 3.09 %
Chiens de Fondation

Apport
génétique

Speedy (import récent)
Amanar
(import récent)
Toboro II
Takadamat
Adignaz
Targui
Gao
C'Babasch
Lara
Ahoura
Darkoye Sidi
Aikar
B'Tekewelt
Ejeker

25%
25%
12.9%
7.03%
6.45%
4.69%
4.1%
3.12%
2.54%
2.34%
1.95%
1.76%
1.56%
1.56%

Exemples chez des chiens issus de mariages avec de nouveaux imports depuis plusieurs générations

Pedigree 9 - Autriche 2002
Consanguinité totale: 1.77 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

Salome
Aikar Azoul Elkor
Ajor Ag Tinakouf

C'Babasch
Gao
Toboro II
Akschi
B'Tekewelt
Ejeker
Adignaz
Takadamat
Lara
Targui
Darkoye Sidi
Ahoura
Aikar

12.5%
12.5%
12.5%

10.9%
8.11%
7.81%
6.25%
5.47%
5.47%
3.61%
3.52%
3.42%
3.12%
2.15%
1.56%
1.07%

 

Pedigree 10 - USA 2003
Consanguinité totale: 0 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

Taytok
Gao
Taikoussou
Azabor (3)
Atri ak Mansoufouga
Toboro II
Lara
C'Babasch
Targui
Takadamat
Darkoye Sidi
Adignaz
B'Tekewelt
Ejeker
Ahoura
Aikar

50%
7.62%
6.25%
6.25%
6.25%

4.49%
3.52%
3.12%
2.34%
2.34%
2.15%
1.76%
1.56%
1.56%
0.391%
0.391%

Ici, quatre nouveaux chiens dans les origines (en 3ème et 4ème générations pour le pedigree 9) ont permis de ramener le taux de consanguinté à des niveau nuls avec une répartition équilibrée des chiens de fondations. Nous avons donc aussi à faire à des pedigrees non consanguins.

Pedigree 11 - Allemagne
Consanguinité totale: 4.21 %

Chiens de Fondation

Apport
génétique

Amanar
Dazol In Chenan
Yaris

Gao
Toboro II
Takadamat
Ahoura
C'Babasch
Lara
Adignaz
Aikar
B'Tekewelt
Ejeker
Darkoye Sidi
Targui

25%
18.8%
18.8%

9.28%
5.27%
3.52%
3.52%
3.12%
3.03%
2.44%
2.05%
1.56%
1.56%
1.37%
0.781%

 

Pedigree 12 - USA 2000
Consanguinité totale: 0 %
Chiens de Fondation

Apport
génétique

Inkadewane
Père Alak/Tagalas

C'Babasch
Dazol In Chenan
Yaris

B'Tekewelt
Ejeker

25%
25%

12.5%
12.5%
12.5%

6.25%
6.25%


Ici, nous remarquons que les chiens de fondation des lignées française et yougoslave sont absents. Il s'agit d'un bon pedigree "outcross" (hors consanguinité) à utiliser en mariage avec un pedigree classique français.

Il est possible de faire une analyse d'un mariage envisagé entre deux chiens présents dans la Database. Ceci permet de conforter ou de repenser un projet de portée. Il suffit d'afficher le pedigree d'une chienne et de lui ajouter un mâle grace à la fonction "Partenaire Test". Un nouveau pedigree s'affiche avec la moitié des générations en blanc permettant d'insérer un mâle (Chien 2 - Ajouter) en cliquant sur "Ajouter". On sélectionne le mâle choisi et le pedigree de la portée envisagée est reconstitué. Il suffit alors, comme d'habitude, de consulter les analyses génétiques de ce mariage.

 

Texte & photos copyright © Corine Lundqvist - depuis / since 1998